Oceana ha documentado durante años los fondos marinos del área marina frente a Doñana, con buceadores profesionales y un robot submarino (ROV), realizando casi 100 inmersiones entre 10 y 105 metros de profundidad. El análisis de la información obtenida ha servido para identificar las áreas de mayor interés ecológico y fundamentar la necesidad de protección y gestión de estas ricas aguas.

Los muestreos de Oceana han demostrado la presencia de una gran diversidad de moluscos y peces, así como corales, anémonas y gorgonias, esponjas, ascidias, holoturias, estrellas de mar y erizos o bancos de misidáceos, copépodos y larvas de diferentes especies, entre otros habitantes de estos fondos.

El análisis minucioso de la información recopilada durante años permite determinar las áreas más relevantes en cuanto a biodiversidad, como puede ser el frente costero de Rota y Chipiona, donde se hallan afloramientos rocosos con densos bosques de coral árbol (Dendrophyllia ramea), corales Caryophyllia spp. y vistosas colonias de coral anaranjado (Astroides calycularis). Esta última es una especie protegida que nunca se había visto frente a Doñana hasta que la filmó Oceana y encuentra aquí su distribución más occidental conocida. 

Más al norte, frente a Mazagón, encontramos también fondos rocosos con gorgonias como Leptogorgia sarmentosa o Elisella paraplexauroides, esponjas y otros muchos invertebrados, formando hábitats de importancia para numerosas especies, algunas de ellas de elevado valor comercial. Otras zonas no rocosas, compuestas enteramente por fondos fangosos, albergan muchas especies de valor comercial y ecológico, por lo que también precisan ser gestionadas correctamente.